武汉市妇女儿童医疗保健中心于2003年9月成立，由武汉市儿童医院（始建于1954年）和武汉市妇幼保健院（始建于1992年）组成。中心拥有四个门诊部和800张病床的现代化病房大楼。病区内设中央空调、中心负压吸引、中心供氧系统，专科设置齐全，有小儿内、外、眼、耳鼻咽喉、皮肤、口腔、中医、康复、妇产、麻醉科等临床科室及儿童保健科、妇女保健科、基层指导科等预防保健科室，设有药剂、检验、放射、超声、内窥镜、CT·MRI、心电、脑电、高压氧、病理等医技科室。其中儿内科分有血液、心脏、呼吸、消化、新生儿、肾脏、神经、内分泌、急救等专业，儿外科分为普外、矫形、心胸、神经、泌尿、新生儿及腹腔镜等专业。小儿心胸外科、生殖健康科、小儿耳鼻咽喉科、小儿神经内科、小儿普外科为市级重点专（学）科，小儿CT与MRI影像诊断科、新生儿科、医学检验科、医学分子生物学与免疫学是市级重点专（学）科建设单位。

市妇幼保健院在全市建立了辐射13个区1028个社区的三级妇幼保健服务网络和妇女儿童疾病监测网络，在全国率先开展了婚检人群艾滋病筛查，并在全市广泛开展了新生儿疾病筛查，产前唐氏综合症筛查工作。

1996年市儿童医院被湖北省卫生厅评定为全省专科医院中的首家“三级甲等医院”，1998年被湖北省卫生厅授予“湖北省文明行业示范医院”荣誉称号，并于同年跨入全国“百佳医院”行列。市妇幼保健院被卫生部确定为中国儿童卫生保健指导中心，被授予“爱婴医院”称号。2004年，中心被市文明委、市卫生局确定为武汉地区第一批文明品牌医院。2005年中心被省委、省政府授予“文明单位”称号，2007年被省委、省政府授予“最佳文明单位”荣誉称号。